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产品介绍

10x Genomics推出的免疫谱解决方案（The Chromium Single Cell Immune Profiling）可以同时检测几百至数万个T细胞和B细胞的多态性以及基因表达情况，揭示细胞多样性
、抗原特异性和细胞组分等
，为免疫组学研究提供扩展性平台

。

该技术利用油包水微滴的核酸barcode分配系统，通过微流体技术，将barcode分配给单个细胞。通过选择5’端接头的通用引物和免疫分子恒定区的巢式引物进行V(D)J富集，可在单个细胞中同时获取TCR/BCR的V(D)J全长序列。在免疫学、自身免疫性疾病和疫苗研究等领域具有广泛的应用前景。

应用方向

技术优势

技术参数

实验流程

基于微流体技术将单个细胞、带有barcode序列和引物序列的凝胶微珠以及逆转录反应体系包裹在油滴中，形成GEMs
。随后
，细胞裂解，释放mRNA，合成barcode标记的cDNA第一链
。GEMs裂解后
，利用通用引物扩增全长cDNA序列
。接下来，分别构建5’基因表达谱文库和免疫谱文库。其中，免疫谱文库构建是利用V(D)J的引物扩增获得TCR以及BCR序列，回收PCR扩增产物后
，对产物进行酶切
、末端修复
、加A碱基等，完成文库的构建。

生物信息分析流程

重要分析结果展示

经典案例解析

乳腺癌微环境中不同免疫表型的单细胞图谱

了解肿瘤微环境中的免疫细胞表型对理解肿瘤进展机制和免疫治疗反应至关重要。作者从8名乳腺癌患者的肿瘤样本及配对的正常组织、血液和淋巴结样本中获得45,000个免疫细胞，并利用inDrop技术对其进行单细胞表达谱测序
，而后对这些数据进行了聚类分析和细胞类型鉴定。尽管正常和肿瘤组织固有免疫细胞有显著的相似性，作者观察到肿瘤微环境的表型存在异质性。随后
，作者利用10x Genomics公司的单细胞免疫谱方法检测了乳腺癌组织的27,000个T细胞的配对的单细胞表达谱和TCR信息，通过生物信息分析发现TCR表型组合的多样性


。这些结果支持在癌症中T细胞持续激活的模型，有助于更好地了解免疫细胞促进和延缓肿瘤生长背后的分子机制。