产品介绍
Small RNA是一大类调控分子,包括miRNA、siRNA、snoRNA、piRNA和rasiRNA等。其中,miRNA是一大类调控分子,包括miRNA、siRNA、snoRNA、piRNA和rasiRNA等。其中,miRNA是一类内生的、长度约为20-24个核苷酸的小RNA分子,其在细胞内主要通过降解mRNA、抑制翻译、调控异染色质形成等途径参与调控生物体的生长发育和疾病发生。每个miRNA可以有多个靶基因,几个miRNA也可以靶向同一个基因,从而形成复杂的调控网络。
应用方向
技术参数
实验流程
生物信息分析流程
重要分析结果展示
经典案例解析
利用Small RNA测序发现急性缺血性中风的生物标志物
研究人员对20位急性缺血性中风(IS)患者和20位健康人(HC)的血浆样本进行Small RNA测序,鉴定到32个差异表达(FDR<0.05)的miRNA。随后,研究人员利用qRT-PCR在40位IS患者和40位HC的验证样本,以及200位IS患者、100位HC和72位短暂性脑缺血(TIA)患者的重复样本中进一步验证出有三个miRNA(miR-125a-5p、miR-125b-5p 和 miR-143-3p)的表达量在IS患者中显著上调(图7)。此外,研究人员发现这三个miRNA主要来源于血小板。通过受试者工作特性曲线(ROC Curve)分析,研究人员发现miR-125a-5p、miR-125b-5p 和 miR-143-3p的曲线下面积(AUC)大于其他蛋白标志物(图8A-C),可以很好的区分IS患者和HC人群。但是在IS患者和TIA患者中,这三个miRNA的AUC为0.663,而三个miRNA和蛋白标志物组合的AUC为0.661,不能显著区分IS患者和TIA患者(图8D)。