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  • 转录组

    产品介绍

    转录组(Transcriptome)是指细胞内所有转录产物的集合,包括mRNA 、non-coding RNA等。转录组具有时空特异性,通过转录组能够从转录水平研究基因功能以及基因结构,揭示特定生物学以及疾病发生过程中的分子机理 。 转录组测序(RNA-seq)是利用高通量测序获取转录组中mRNA的信息,通过分析基因表达量以及结构的变化,挖掘致病机制 ,阐明发病机理 ,指导用药以及药物研发 。


    应用方向


    技术参数

    实验流程

    生物信息分析流程

    重要分析结果展示

    经典案例解析

    RNA-seq发现青年白血病患者特有的DUX4融合基因

    研究人员对73位青年白血病(ALL)患者(54例B细胞ALL、18例T细胞ALL和1例未知来源ALL ,均不携带费城染色体)的骨髓单核细胞进行RNA-seq,共发现26个融合基因,其中12个为新发现的融合基因。在淋巴B细胞ALL患者中 ,易发生融合的基因包括DUX4、XNF384和MEF2D(图8a) 。其中,DUX4融合基因仅存在青年人群,而携带该融合基因的患者的无疾病生存期长于费城染色体患者(图8b-d) 。研究表明,DUX4基因位于4号染色体长臂近端粒处的D4Z4重复区域 ,在青年ALL人群中 ,DUX4基因插入14号染色体上的IGH位点(图9a-c) 。通过小鼠疾病模型,研究人员发现DUX4和IGH融合基因具有致癌活性,能够促进淋巴B细胞增殖 ,导致淋巴B细胞白血病的发生(图9d-e) 。

    上一篇 : 小RNA测序
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