产品介绍
转录组(Transcriptome)是指细胞内所有转录产物的集合,包括mRNA、non-coding RNA等。转录组具有时空特异性,通过转录组能够从转录水平研究基因功能以及基因结构,揭示特定生物学以及疾病发生过程中的分子机理。 转录组测序(RNA-seq)是利用高通量测序获取转录组中mRNA的信息,通过分析基因表达量以及结构的变化,挖掘致病机制,阐明发病机理,指导用药以及药物研发。
应用方向
技术参数
实验流程
生物信息分析流程
重要分析结果展示
经典案例解析
RNA-seq发现青年白血病患者特有的DUX4融合基因
研究人员对73位青年白血病(ALL)患者(54例B细胞ALL、18例T细胞ALL和1例未知来源ALL,均不携带费城染色体)的骨髓单核细胞进行RNA-seq,共发现26个融合基因,其中12个为新发现的融合基因。在淋巴B细胞ALL患者中,易发生融合的基因包括DUX4、XNF384和MEF2D(图8a)。其中,DUX4融合基因仅存在青年人群,而携带该融合基因的患者的无疾病生存期长于费城染色体患者(图8b-d)。研究表明,DUX4基因位于4号染色体长臂近端粒处的D4Z4重复区域,在青年ALL人群中,DUX4基因插入14号染色体上的IGH位点(图9a-c)。通过小鼠疾病模型,研究人员发现DUX4和IGH融合基因具有致癌活性,能够促进淋巴B细胞增殖,导致淋巴B细胞白血病的发生(图9d-e)。